More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11203 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 362 aa  707    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  80.83 
 
 		 379 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  81.07 
 
 		 359 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  80.37 
 
 		 330 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  80.37 
 
 		 330 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  80.37 
 
 		 330 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  70.08 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  69.12 
 
 		 368 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.03 
 
 		 363 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.3 
 
 		 370 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  64.72 
 
 		 365 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  66.76 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  66.48 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  66.48 
 
 		 359 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  65.93 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  62.64 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.33 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.71 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  62.32 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.79 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  60.22 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.62 
 
 		 328 aa  362  6e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.17 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.22 
 
 		 618 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  56.33 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  55.73 
 
 		 396 aa  352  8.999999999999999e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.7 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  57.06 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  59.51 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  56.59 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  54.4 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.35 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.27 
 
 		 379 aa  325  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  58.05 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.48 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  38.94 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  38.04 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  38.33 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.33 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.63 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  34.03 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.46 
 
 		 394 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  31.38 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.46 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  32.37 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  32.02 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  32.63 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  32.81 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  32.81 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  32.81 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  31.93 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  32.55 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  32.29 
 
 		 413 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  31.76 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  31.84 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  30.5 
 
 		 402 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  31.05 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 409 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  38.29 
 
 		 361 aa  152  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  31.84 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 		 398 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  34.26 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  31.32 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  31.58 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  31.58 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  35.64 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  31.58 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  31.32 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  33.61 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.21 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.44 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.4 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  31.58 
 
 		 411 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  31.32 
 
 		 411 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  31.25 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  30.79 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  31.05 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  30.33 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  32.47 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.55 
 
 		 388 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  30.99 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  30.79 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>