More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5502 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 361 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  65.56 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.53 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.78 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  63.09 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  64.25 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  61.73 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  60.88 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.23 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.94 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.89 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.22 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  60.06 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  60.83 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.78 
 
 		 618 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.25 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.82 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  58.67 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.5 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.82 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.9 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  55.11 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.3 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.08 
 
 		 382 aa  349  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  57.34 
 
 		 373 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.8 
 
 		 328 aa  345  5e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  54.05 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  53.15 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.93 
 
 		 379 aa  342  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  56.32 
 
 		 353 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  53.69 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  55.98 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  56.42 
 
 		 382 aa  318  9e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  47.91 
 
 		 392 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.3 
 
 		 285 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.2 
 
 		 411 aa  272  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  39.19 
 
 		 396 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  38.95 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  39.02 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.48 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.05 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 		 399 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.15 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.84 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  32.11 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  38.73 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  36.71 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.74 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.11 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.11 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.28 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  31.15 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  32.89 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  33.25 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  32.82 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  32.98 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  32.22 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  31.85 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.76 
 
 		 402 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  32.32 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  31.64 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  29.13 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  29.08 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.58 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  31.5 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.24 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.13 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  33.07 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  32.13 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  29.95 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2123  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00510874  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  30.3 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  29.8 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  30.05 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  31.49 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  30.71 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  32.47 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  30.75 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  30.97 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2213  aminotransferase class I and II  32.64 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  29.9 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  30.79 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  32.06 
 
 		 398 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  32.75 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  30.3 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  30.53 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.2 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1905  aspartate aminotransferase  27.99 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  31.06 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  30.89 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  31.05 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.65 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  30.79 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  31.23 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  30.26 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  30.63 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1724  aminotransferase  32.38 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  31.05 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.65 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  31.05 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>