More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  100 
 
 		 378 aa  729    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  70.77 
 
 		 379 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  66.49 
 
 		 382 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  59.39 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.2 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.13 
 
 		 379 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.3 
 
 		 382 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  63.99 
 
 		 383 aa  411  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  69.44 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  63.1 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  61.37 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  61.48 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.18 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  61.1 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  57.14 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.47 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  57.22 
 
 		 376 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  57.38 
 
 		 359 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.51 
 
 		 362 aa  355  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.92 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  58.2 
 
 		 359 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.77 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.1 
 
 		 618 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.38 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.6 
 
 		 330 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.6 
 
 		 330 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.01 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  56.58 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.63 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  55.99 
 
 		 368 aa  325  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  55.98 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.51 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.98 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.35 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  55.14 
 
 		 373 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  41.23 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  40.39 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  40.11 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.83 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  36.57 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  35.04 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  36.67 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.94 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  35.97 
 
 		 402 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  32.24 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  32.46 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  36.05 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.36 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.07 
 
 		 402 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 		 399 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  39.61 
 
 		 361 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  34.01 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  31.83 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  33.59 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.37 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  33.33 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.63 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.91 
 
 		 396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.86 
 
 		 386 aa  166  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  31.77 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.29 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  36.96 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.29 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  31.51 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  31.95 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  32.83 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  33.07 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.25 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  32.28 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  34.01 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  34.61 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  29.4 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.43 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  32.19 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.24 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  34.42 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  32.58 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  34.55 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  32.3 
 
 		 402 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  32.3 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  32.3 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  32.3 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  31.52 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  31.52 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  33.85 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  34.91 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  30.87 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1415  aspartate aminotransferase  30.69 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  32.25 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0146  aspartate aminotransferase  29.63 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126801  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  30.39 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  29.63 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  30.39 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>