More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4601 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 398 aa  789    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  52.7 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  52.14 
 
 		 460 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  50 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  49.49 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  49.49 
 
 		 392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  49.49 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  0.0000032787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  45.59 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  45.05 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  46.46 
 
 		 399 aa  332  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  47.52 
 
 		 401 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  47.85 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  45.11 
 
 		 402 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  44.86 
 
 		 402 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  44.22 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  44.92 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  44.92 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  46.35 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  45.2 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  46.46 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  44.42 
 
 		 398 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  44.16 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  44.16 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  44.56 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  46.6 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  43.15 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  44.16 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  43.83 
 
 		 405 aa  312  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  45.78 
 
 		 406 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  45.5 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  45.78 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  44.16 
 
 		 398 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  43.91 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  43.77 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  47.36 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  42.57 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  41.6 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  41.75 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  41 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  41.01 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  42.82 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  42.75 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  42.75 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  41.46 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  42.75 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  43.36 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  40.34 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  42.25 
 
 		 410 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  43.69 
 
 		 397 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  43 
 
 		 420 aa  299  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  43.75 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  41.45 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  43.39 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  41.75 
 
 		 434 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  43.39 
 
 		 401 aa  296  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  45.32 
 
 		 399 aa  296  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  44.72 
 
 		 410 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  45.01 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  38.78 
 
 		 408 aa  292  5e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  38.85 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  43.08 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  44.9 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  43.11 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  44.87 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  40.25 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  43.52 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  43.52 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  43.52 
 
 		 415 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  43.39 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  43.52 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  43.52 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  43.28 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  45.38 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  44.27 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  42.61 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  44.01 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  43.58 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  42.29 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  44.1 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  41.73 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  39.85 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  44.72 
 
 		 416 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  41.21 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  36.32 
 
 		 378 aa  240  4e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  34.33 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 		 383 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.89 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.61 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  35.22 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.15 
 
 		 379 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.45 
 
 		 391 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  29.68 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  33.93 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.58 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>