More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2061 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  98.96 
 
 		 420 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  94.5 
 
 		 410 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  95.81 
 
 		 410 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  82.46 
 
 		 434 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 		 387 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  85.2 
 
 		 420 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  97.38 
 
 		 410 aa  760    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  83.73 
 
 		 405 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  83.46 
 
 		 405 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  97.38 
 
 		 410 aa  760    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  97.38 
 
 		 410 aa  760    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  85.53 
 
 		 415 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  85.53 
 
 		 410 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  85.53 
 
 		 410 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  85.53 
 
 		 410 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  85.27 
 
 		 410 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  85.53 
 
 		 410 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  75.93 
 
 		 399 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  75.66 
 
 		 399 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  74.87 
 
 		 417 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  72.25 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  74.01 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  70.08 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  66.58 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  67.96 
 
 		 405 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  68.42 
 
 		 400 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  66.93 
 
 		 407 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  67.1 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  66.05 
 
 		 397 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  68.06 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  66.75 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  64.66 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  67.19 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  65.27 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  62.89 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  67.54 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  67.28 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  64.21 
 
 		 398 aa  481  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  55.84 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  56.51 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  55.32 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  56.2 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  56.69 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  56.02 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  54.91 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  55.5 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  54.97 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  53.93 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  53.93 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  54.69 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  54.21 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  54.43 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  53.83 
 
 		 397 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  54.17 
 
 		 399 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  54.17 
 
 		 398 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  50.52 
 
 		 412 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  50.92 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  54.07 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  50.39 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  53.89 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  48.28 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  51.71 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  51.3 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  50.65 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  50.65 
 
 		 406 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  47.79 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  43.21 
 
 		 393 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  41.6 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  41.3 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  43.09 
 
 		 393 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  0.0000032787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  40.54 
 
 		 460 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  41.21 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  40.65 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  40.65 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  40 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  40.49 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  41.35 
 
 		 423 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  37.67 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  41.03 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  40.76 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  40.86 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  40.49 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  39.47 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  38.73 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  35.99 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  35.69 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.77 
 
 		 383 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  35.15 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.72 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.15 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.52 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.91 
 
 		 389 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.87 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.08 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  32.61 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.08 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.65 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>