272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1288 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  43.42 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  44.74 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  50.38 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  48.48 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  45.14 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  44.9 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  41.72 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  40.13 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  43.23 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  43.24 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  42.25 
 
 		 145 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  43.79 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  41.89 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  39.86 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  52.68 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  48.44 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  41.1 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  47.69 
 
 		 132 aa  119  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  40.43 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  38.89 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  45.04 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  46.9 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  40.41 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  40.41 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  41.26 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  39.39 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  35 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  41.13 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  42.34 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  46.73 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  44.14 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  37.21 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  44.25 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  36.73 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  43.36 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  48.51 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  37.21 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  41.23 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  51.55 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  54.74 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  42.74 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  34.23 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  38.17 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  52.34 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  46.67 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  37.4 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  36.76 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  45.71 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  40.18 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  44.78 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  44.63 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  37.4 
 
 		 141 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  37.4 
 
 		 141 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  36.23 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  41.94 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  44.86 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  48.28 
 
 		 163 aa  94.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  46.23 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  46.23 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  42.98 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  45.28 
 
 		 136 aa  94  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  32.31 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  40.52 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  35.88 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  45.28 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 136 aa  93.2  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  39.34 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  42.15 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  41.73 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  46.23 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2430  large conductance mechanosensitive channel protein  32 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.569149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  41.32 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  34.31 
 
 		 174 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  41.51 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  48.54 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  40.32 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  41.12 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>