270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0241 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  67.39 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  63.38 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  63.38 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  62.68 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  60.28 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  57.58 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  47.52 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  50.71 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  48.61 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  50.7 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  59.82 
 
 		 123 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  52.07 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  48.92 
 
 		 139 aa  121  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  48.23 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  51.45 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  57.27 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  49.65 
 
 		 137 aa  120  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  50.77 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  47.52 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  50.76 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  52.27 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  47.52 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  47.22 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  50.76 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  50.76 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  52.27 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  46.85 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  48.48 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  47.48 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  50.76 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  47.48 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  47.73 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  56.19 
 
 		 153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  43.84 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  49.24 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  49.24 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  49.24 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  51.08 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  49.24 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  43.54 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  43.84 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  43.54 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  43.84 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  43.84 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  46.67 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  46.62 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  54.05 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  45.52 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  51.94 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  45.71 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  41.48 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  45.52 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  45.65 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  44.68 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  44.68 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>