270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2389 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 150 aa  306  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  68.24 
 
 		 152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  67.57 
 
 		 155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 150 aa  183  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  57.72 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  50.67 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  50.98 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  59.46 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.28 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  49.03 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  51.7 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  50.33 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  47.02 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  47.59 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  48.68 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  44.74 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  48.98 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  51.95 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  64.55 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  56.03 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  46.36 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  46.36 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  58.41 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  61.82 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  52.74 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  61.82 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  55.17 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  53.66 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  58.04 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  42.48 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  54.33 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  54.47 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  57.6 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  53.51 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  50.71 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  55.08 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  44.9 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  43.45 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  52.63 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  50.39 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 199 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  56.25 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  44.68 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  41.06 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  44.29 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  53.27 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  42.57 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  47.76 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  54.46 
 
 		 137 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  48.55 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  50.38 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  44.52 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  52.43 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  55.96 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  47.01 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  55.05 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  54.87 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  59.43 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  48.82 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  49.61 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  56.3 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  53.98 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  50.4 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  50.39 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  52.46 
 
 		 145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  48.44 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>