270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0172 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  60.56 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  55.94 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  55.1 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  55.1 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  57.72 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  54.05 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  52.7 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  52.7 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  58.9 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  51.32 
 
 		 155 aa  157  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  51.28 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  52.03 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  52.03 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  55.03 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  48.37 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  51.97 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.28 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  54.61 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  49.3 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  48.59 
 
 		 142 aa  141  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  54.17 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  55.74 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  48.85 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  46.9 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  43.33 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  49.59 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  52.99 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  54.62 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  57.66 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  55.2 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  51.97 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  53.98 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  46.1 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  57.02 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  54.55 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  53.72 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  39.86 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  50.89 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  53.64 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  50.41 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  54.95 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  48.03 
 
 		 199 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  55.96 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  44.68 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  54.95 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  47.48 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  52.42 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  52.89 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  45.52 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  44.93 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  51.18 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  56.41 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  50.82 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  53.72 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  46.1 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  50.81 
 
 		 145 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  48.87 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  52.1 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  46.21 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  53.64 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>