269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2963 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 142 aa  277  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  80.99 
 
 		 151 aa  228  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  79.58 
 
 		 142 aa  219  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  80.28 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  73.94 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  73.94 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  68.09 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  72.03 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  69.01 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  68.31 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  66.9 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  66.9 
 
 		 141 aa  182  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  70.21 
 
 		 144 aa  182  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  68.31 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  64.79 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  66.2 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  60.14 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  65.49 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  60.14 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 199 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  66.9 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  62.76 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  62.76 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  62.76 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  62.76 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  63.19 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  61.54 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  60.99 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  68.7 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  65.97 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  61.38 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  62.07 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  59.15 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  59.03 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  56.43 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  60.69 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  58.16 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  59.15 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  55.4 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  55 
 
 		 138 aa  147  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  55 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  55.8 
 
 		 163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  57.04 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  51.77 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  57.48 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  51.05 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  57.03 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  52.78 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  57.34 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  55.71 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  48.98 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  52.11 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  49.32 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  48.98 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  51.05 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  52.48 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  50.72 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  51.77 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  57.04 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  51.77 
 
 		 154 aa  129  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  49.28 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  49.28 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  50.72 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  48.23 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  48.23 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  48.59 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  48.23 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  52.41 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  48.06 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>