271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  49.25 
 
 		 153 aa  147  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  48.65 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  47.68 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  48.23 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  48.98 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  43.54 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  46.36 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  43.33 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  44.87 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  45.07 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  43.15 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  43.05 
 
 		 157 aa  123  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  43.42 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  40.52 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  43.84 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  43.05 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  61.29 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  40.65 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  38.06 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  38.06 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  47.93 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  49.66 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  45.14 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  45.14 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  52 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  38.26 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  52 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  40.56 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  35.81 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  43.62 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  47.9 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  51.2 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  51.2 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  47.73 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  51.2 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  45.9 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  44.78 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  46.88 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  51.46 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  42.03 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  53.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  36.99 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  46.46 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  44.09 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  47.58 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  56.12 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  53 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  38.52 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  51.89 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  43.31 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  44.88 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  47.15 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  40.94 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  41.91 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  42.54 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  52.81 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  34.87 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  35.17 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  49.04 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  52.58 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  52.58 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  52.58 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  52.58 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  52.58 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  48.42 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>