271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  67.13 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  48.23 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  48.18 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  47.69 
 
 		 136 aa  119  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  49.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  41.72 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  48.89 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  48.46 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  42.47 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  41.96 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  40.71 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  39.29 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  40.13 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  46.67 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  37.86 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  37.93 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  47.46 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  40.44 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  40.62 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  47.11 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  40.88 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  38.26 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  38.82 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  38.56 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  35.95 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  35.95 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  36.18 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  43.44 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  43.44 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  41.96 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  42.28 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  37.06 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  44.62 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  39.85 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  37.09 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  39.16 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  41.79 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  33.56 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  43.33 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  42.98 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  34.72 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  43.94 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  41.06 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  38.85 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  42.5 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  39.02 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  42.74 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  38.85 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  41.44 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  38.85 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  37.4 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  53.47 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  35.1 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  34.48 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  35.82 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  37.06 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  37.76 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  45.37 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  39.02 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  38.1 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  41.07 
 
 		 145 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  39.5 
 
 		 176 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  45.9 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  38.64 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  38.98 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  38.3 
 
 		 139 aa  85.9  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  40.87 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  31.97 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>