269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0624 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 176 aa  353  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  49.67 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  44.52 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  38.99 
 
 		 274 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  46.97 
 
 		 151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  48.8 
 
 		 126 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  39.43 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 131 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  47.83 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  46.11 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  50.4 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 		 129 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 132 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  38.27 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  38.27 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  44.81 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 		 132 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  41.91 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  41.79 
 
 		 131 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  42.54 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  44.27 
 
 		 130 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  41.94 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  45.16 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  42.55 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 		 126 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  44.64 
 
 		 134 aa  97.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  41.32 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  42.98 
 
 		 134 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  36.96 
 
 		 138 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  36.96 
 
 		 138 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  41.98 
 
 		 131 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  41.6 
 
 		 122 aa  94.4  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  37.14 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 		 130 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  39.72 
 
 		 136 aa  92.4  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 136 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 136 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 		 121 aa  92  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  39.71 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 138 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  39.39 
 
 		 136 aa  91.3  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 125 aa  90.9  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  52.27 
 
 		 147 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  41.6 
 
 		 123 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  41.82 
 
 		 135 aa  90.1  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 137 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 137 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  44.6 
 
 		 143 aa  90.1  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  39.31 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  40.88 
 
 		 143 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  38.57 
 
 		 146 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  39.39 
 
 		 136 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  36.43 
 
 		 146 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 		 126 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 138 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  39.42 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  40.15 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  39.39 
 
 		 136 aa  88.2  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  34.78 
 
 		 138 aa  88.2  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 145 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  39.5 
 
 		 132 aa  87  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  40.31 
 
 		 134 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  38.89 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  40.71 
 
 		 141 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  40.46 
 
 		 127 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  40.71 
 
 		 141 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 132 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 132 aa  85.1  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 132 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 		 132 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  40.29 
 
 		 140 aa  85.1  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  38.64 
 
 		 135 aa  85.1  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  38.46 
 
 		 132 aa  84.7  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  39.71 
 
 		 139 aa  84.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 127 aa  84.7  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 136 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>