267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0090 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 151 aa  290  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  50.36 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  50.72 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  43.97 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  49.28 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  43.75 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  44.85 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  46.38 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  40.15 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  40.52 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  41.89 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  41.3 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  42.66 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  38.56 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  38.56 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  41.91 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  40.3 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  40.69 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  39.42 
 
 		 274 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  38.56 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  36.17 
 
 		 126 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  38.46 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  40.4 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  36.81 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  39.13 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  42.76 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  41.01 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  42.25 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  39.31 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  39.72 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  44.37 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  44.37 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  44.37 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  37.68 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  38.06 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 199 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  35.81 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  42.03 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  41.06 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  46.9 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  43.04 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  37.58 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  36.91 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  37.58 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  36.91 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  41.84 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  36.91 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  41.96 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  40.4 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  41.13 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  36.91 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  37.59 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  37.98 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  35 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  41.43 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  40.29 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  41.3 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  42.06 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  40.29 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  42.36 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  45 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  37.23 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  37.76 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  39.01 
 
 		 132 aa  84  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>