270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2403 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 121 aa  235  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  59.5 
 
 		 123 aa  139  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  61.6 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  62.3 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  52.89 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  49.59 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  47.93 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  46.32 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  41.96 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  41.96 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  42.76 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  45.52 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  49.6 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  44.85 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  42.64 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  42.42 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  42.45 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  42.14 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  43.17 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  44 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  44.62 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  40.29 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  42.31 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  39.55 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  44.96 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  40.43 
 
 		 199 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  46.46 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  41.04 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  42.64 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  38.69 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  43.9 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  42.31 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  45.87 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  42.75 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  42.03 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  44.27 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  38.69 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  42.64 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  44.62 
 
 		 168 aa  93.6  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  40.85 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  40.71 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  39.29 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  39.53 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  42.64 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  42.64 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  41.98 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  42.06 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  41.98 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  39.67 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  41.86 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  43.41 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  47.97 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  41.94 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>