264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4648 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 146 aa  286  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  53.73 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  49.67 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  48.51 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  44.52 
 
 		 274 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  48.84 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  47.66 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  44.88 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  40.38 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  44.22 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  47.5 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  36.57 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  43.85 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  39.37 
 
 		 169 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  41.98 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  39.37 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  40.48 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  39.06 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  37.88 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  38.97 
 
 		 168 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  47.47 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  43.85 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  38.81 
 
 		 201 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  38.73 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  42.34 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  39.69 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  39.16 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  40.6 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  37.32 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  35.29 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  36.62 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  44.74 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  35.82 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  34.53 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  36.3 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  39.5 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  39.57 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  39.2 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  40.78 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  33.08 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  37.12 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  34.62 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  34.65 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  35.38 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  35.61 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  35.25 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  33.09 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  33.83 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  37.88 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  36.15 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  34.27 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  36.55 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  34.56 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  35.34 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  36.03 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  35.61 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  33.08 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  33.82 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  33.82 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  36.03 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  36.03 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  36.03 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  35.66 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  36.22 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  33.85 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  33.09 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  36.78 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  33.58 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  34.04 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  37.12 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  36.3 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  31.91 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  34.88 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  33.57 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>