266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3277 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 148 aa  290  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  45.56 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  55.38 
 
 		 274 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  47.69 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  47.69 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  47.69 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  48.55 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  49.3 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  44.22 
 
 		 146 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  46.67 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  45.77 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  45.07 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  44.8 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  47.5 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  45 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  49.32 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  44.78 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  39.71 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  44.03 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  41.04 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  44.09 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  38.71 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  43.08 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  38.06 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  47.52 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  39.01 
 
 		 201 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  39.1 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  45.86 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  37.96 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  46.24 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  44.12 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  39.69 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  43.43 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  41.98 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  36.76 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  38.64 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  37.59 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  34.46 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  38.57 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  40.91 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  35.97 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  38.57 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  39.86 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  38.57 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  35.66 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  38.57 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  39.06 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  37.8 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  35.66 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  35.66 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  35.04 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  33.08 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  38.97 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  36.51 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  35.94 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  33.81 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  38.02 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  34.33 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  36.57 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  35.61 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  34.27 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  33.81 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  37.96 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  33.81 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  37.14 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  36.62 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  36.17 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  33.58 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  34.07 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  33.86 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  39.23 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  35.71 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  32.43 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  37.31 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  35.29 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  35.16 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  43 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  33.83 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  32.82 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  34.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  32.58 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  34.53 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>