269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3196 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 
134 aa  262  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  73.88 
 
 
140 aa  206  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0033  large-conductance mechanosensitive channel  64.93 
 
 
134 aa  165  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0027  large-conductance mechanosensitive channel  65.67 
 
 
134 aa  164  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  61.31 
 
 
137 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  154  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  59.85 
 
 
137 aa  153  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  59.56 
 
 
139 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  58.82 
 
 
139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  58.82 
 
 
148 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  57.35 
 
 
137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  57.35 
 
 
137 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  58.82 
 
 
137 aa  149  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  56.93 
 
 
141 aa  149  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  56.2 
 
 
134 aa  149  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  58.09 
 
 
139 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  57.35 
 
 
136 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  57.25 
 
 
135 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  56.93 
 
 
148 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  54.41 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  57.25 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  57.35 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  56.2 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  56.2 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  59.12 
 
 
139 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  56.72 
 
 
134 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  61.31 
 
 
137 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  61.31 
 
 
137 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  61.31 
 
 
137 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  61.31 
 
 
137 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  54.93 
 
 
151 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  61.31 
 
 
137 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  55.15 
 
 
136 aa  140  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  51.72 
 
 
139 aa  140  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
136 aa  140  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  60.58 
 
 
138 aa  140  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  54.23 
 
 
142 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 
144 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 
155 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  54.74 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  56.52 
 
 
136 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  52.11 
 
 
143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  52.11 
 
 
143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  59.17 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  55.12 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  55.47 
 
 
163 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  52.9 
 
 
138 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  59.32 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  50.71 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  51.47 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  50.74 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  50.74 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  54.23 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  50.75 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  51.47 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  51.49 
 
 
127 aa  124  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  49.64 
 
 
131 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
134 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  48.92 
 
 
141 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  48.03 
 
 
161 aa  124  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  48.53 
 
 
131 aa  124  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  49.3 
 
 
142 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  47.83 
 
 
126 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  53.23 
 
 
152 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  52.42 
 
 
155 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  52.82 
 
 
142 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  50.83 
 
 
156 aa  122  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 
135 aa  122  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  50.36 
 
 
142 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>