263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2915 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 130 aa  261  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  84.38 
 
 		 129 aa  223  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  47.06 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  46.03 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  49.62 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  47.27 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  43.2 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  40.46 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  41.27 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  43.07 
 
 		 166 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  40.46 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  44.7 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  45.6 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  40.31 
 
 		 130 aa  93.2  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  41.41 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  35.51 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  37.76 
 
 		 201 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  41.44 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  38.46 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  39.85 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  44.79 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  41.09 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  45.54 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  40.48 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  40.77 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  35.51 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  35.51 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  36.15 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  38.35 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  38.85 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  35.51 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  37.01 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  33.85 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  39.17 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  38.64 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  36.92 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  42.16 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  38.64 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  34.88 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  40.98 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  34.62 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  40.98 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  34.38 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  35.29 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  35.65 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  35.34 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  43.41 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  34.88 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  34.88 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  34.88 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  34.88 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  37.8 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  36.99 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  34.11 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  34.11 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  34.97 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  44.55 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  34.31 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0156  large conductance mechanosensitive channel protein  46 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.024147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  34.27 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  36.22 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  36.17 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  33.56 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  36.92 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  35.34 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  35 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  34.93 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  31.21 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  33.1 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  34.72 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  35.17 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  34.82 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  33.83 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  34.03 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  33.09 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  36.55 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  31.11 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  37.21 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  36.3 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  34.03 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>