271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0317 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 123 aa  239  7e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  61.48 
 
 		 125 aa  153  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  59.5 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  58.06 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  46.34 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  49.26 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  48.59 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  52.68 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  44.72 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  44.6 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  50.79 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  43.17 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  42.66 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 		 136 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  46.21 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  47.29 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  47.29 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  47.48 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  39.29 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  47.93 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  62.63 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  45.99 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  44.36 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  44.36 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  45.04 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  44.96 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  46.32 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 199 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  51.2 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  44.2 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  44.19 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  44.36 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  44.36 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  43.48 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  41.84 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  43.18 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  43.18 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  39.42 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  41.13 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  40.91 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  45.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  41.73 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  42.45 
 
 		 142 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  43.88 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  49.61 
 
 		 149 aa  106  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  42.64 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  43.41 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  44.27 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  41.54 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  41.35 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  41.55 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  48.62 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  40.6 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  42.66 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  44 
 
 		 161 aa  103  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  42.42 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  44.7 
 
 		 134 aa  103  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>