267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3527 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 
143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  62.04 
 
 
136 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  62.04 
 
 
136 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  61.31 
 
 
136 aa  158  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  61.03 
 
 
136 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  59.85 
 
 
136 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  59.42 
 
 
136 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  59.12 
 
 
136 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  59.12 
 
 
136 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  55.07 
 
 
154 aa  151  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  59.12 
 
 
136 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  59.12 
 
 
136 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 
139 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  53.62 
 
 
137 aa  149  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  53.62 
 
 
137 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 
139 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 
139 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 
136 aa  147  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  51.09 
 
 
134 aa  144  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  52.52 
 
 
137 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  52.52 
 
 
137 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  49.28 
 
 
137 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 
136 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
137 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  50.71 
 
 
141 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 
136 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  51.82 
 
 
133 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  52.94 
 
 
134 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  49.28 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  49.64 
 
 
148 aa  135  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  49.28 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  55.88 
 
 
134 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  47.79 
 
 
135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 
138 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  51.49 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  52.78 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  55.4 
 
 
136 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  52.9 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 
143 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  52.59 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  46.81 
 
 
131 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  52.17 
 
 
137 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
138 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  46.32 
 
 
159 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  52.17 
 
 
137 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  52.17 
 
 
137 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  52.17 
 
 
137 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  52.17 
 
 
137 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  47.76 
 
 
132 aa  122  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  47.86 
 
 
132 aa  120  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
132 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
132 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
132 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 
132 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  47.86 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  47.14 
 
 
132 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  46.1 
 
 
133 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  45.39 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  44.78 
 
 
131 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  51.47 
 
 
134 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 
137 aa  116  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  43.97 
 
 
163 aa  116  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  46.48 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  45.77 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  46.32 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  46.43 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  47.06 
 
 
138 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  47.83 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 
139 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 
146 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  49.3 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  47.83 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  47.06 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  46.76 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  50.85 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  46.21 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  44.76 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  48.61 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  48.23 
 
 
139 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  44.29 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  47.52 
 
 
141 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  47.52 
 
 
141 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 
155 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  43.36 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  47.11 
 
 
145 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  43.36 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1655  large conductance mechanosensitive channel protein  50.81 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>