269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0618 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  62.3 
 
 		 121 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  51.2 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  49.61 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  48.2 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  48.2 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  44.83 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  46.27 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  45.21 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  46.21 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  47.1 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  46.38 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  48.2 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  44.88 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  42.75 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  44.14 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  44.52 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  43.8 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  47.62 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  43.28 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  44.85 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  41.61 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  48.84 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  38.97 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  45.53 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  42.03 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  42.03 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  42.07 
 
 		 163 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  41.78 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  42.5 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  38.69 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  41.3 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  42.03 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  38.81 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  42.5 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  44.68 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  38.41 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  41.3 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  41.3 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 199 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  40.58 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  46.97 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  49.07 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  42.66 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  40.46 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  43.33 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  41.48 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  41.3 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  43.07 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  40.97 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  42.47 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  41.18 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  41.18 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  41.61 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  41.61 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  40.28 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  48.54 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  39.69 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  40.28 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  46.09 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  41.43 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  40.44 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  41.04 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  42.65 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  42.64 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  43.48 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  42.03 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  47.75 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  44.27 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  39.1 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  39.1 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>