264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0038 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  59.7 
 
 		 168 aa  163  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  44.03 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  43.07 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  42.76 
 
 		 201 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  40.74 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  43.61 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  39.71 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  36.55 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  42.65 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  40.58 
 
 		 176 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  46.32 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  36.76 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  39.71 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  39.85 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  46.73 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  38.24 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  37.88 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  39.85 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  35.04 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  41.07 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  38.64 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  36.3 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  48.48 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  42.96 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  37.04 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  37.59 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  35.56 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  39.26 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  45.54 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  37.31 
 
 		 274 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  32.89 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  36.5 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  36.5 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  35.25 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  46.32 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  32.82 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  36.5 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  38.24 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  36.94 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  34.44 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  33.56 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  32.89 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  35.43 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  36.03 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  34.46 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  34.07 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  35.43 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  33.11 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  33.78 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  32.68 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  32.41 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  32.21 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  35.33 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  31.72 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  33.56 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  34.46 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  34.51 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  35.19 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  33.78 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  41.05 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  41.05 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  41.05 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  41.05 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  41.05 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  30.87 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  30.22 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  31.69 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  38.95 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  31.65 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2430  large conductance mechanosensitive channel protein  40.26 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.569149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  33.78 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  32.37 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  36.69 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  33.63 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  30.41 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  34.06 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  35.07 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  38.73 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  32.37 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  30.28 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  29.86 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  30.56 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  32.21 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  32.35 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  36.04 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>