270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0712 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 
142 aa  278  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  83.8 
 
 
151 aa  236  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  79.58 
 
 
142 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  78.87 
 
 
142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  72.34 
 
 
144 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  74.65 
 
 
142 aa  197  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  74.65 
 
 
142 aa  197  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  72.03 
 
 
143 aa  196  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  70.42 
 
 
144 aa  189  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  70.42 
 
 
143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  67.36 
 
 
142 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  67.36 
 
 
142 aa  186  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  66.43 
 
 
140 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  65.71 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  65.25 
 
 
141 aa  180  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  65.28 
 
 
143 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  65.28 
 
 
143 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  65.28 
 
 
143 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  66.2 
 
 
142 aa  178  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  64.58 
 
 
143 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  64.58 
 
 
143 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  64.58 
 
 
143 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  70 
 
 
137 aa  176  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  59.57 
 
 
140 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  60.99 
 
 
140 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  63.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  65.49 
 
 
141 aa  174  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  68.22 
 
 
148 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
199 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  62.5 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  64.58 
 
 
143 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  59.29 
 
 
145 aa  161  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  60.27 
 
 
148 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  61.64 
 
 
148 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  58.9 
 
 
149 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  58.04 
 
 
143 aa  153  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  56.64 
 
 
143 aa  152  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  55 
 
 
138 aa  150  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  53.96 
 
 
138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  60.42 
 
 
140 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  55.63 
 
 
142 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  57.55 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  54.86 
 
 
149 aa  144  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  54.86 
 
 
140 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  53.15 
 
 
142 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  54.61 
 
 
138 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  54.01 
 
 
138 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  57.24 
 
 
142 aa  139  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  53.33 
 
 
155 aa  139  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  54.01 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 
139 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  51.05 
 
 
139 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  54.29 
 
 
141 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 
137 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 
137 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  54.29 
 
 
141 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  52.86 
 
 
142 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
142 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  51.77 
 
 
139 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  53.15 
 
 
140 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  51.05 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  49.31 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  51.05 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 
148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  50.68 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  56.78 
 
 
143 aa  130  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 
146 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  51.05 
 
 
148 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  53.33 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  48.2 
 
 
134 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
138 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 
139 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  50.71 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 
139 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  45.21 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 
136 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  50.34 
 
 
141 aa  124  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  52.41 
 
 
145 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  47.95 
 
 
163 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  47.55 
 
 
136 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>