259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4049 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  53.73 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  48.87 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  44.52 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  46.75 
 
 		 274 aa  117  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  52.34 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  43.36 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  48.55 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 151 aa  97.1  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  42.28 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  37.58 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  37.58 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  40.71 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  40.46 
 
 		 132 aa  93.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  42.14 
 
 		 201 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  39.58 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  43.31 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  42.42 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  37.25 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  44.76 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  39.87 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  43.8 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  41.46 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  40.62 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  34.85 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  50.51 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  38.17 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  38.93 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  42.64 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  48.98 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  35.61 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  38.93 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  34.62 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  37.86 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  34.85 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  38.17 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  36.88 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  35.82 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  35.21 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  42 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  34.78 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  36.09 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  36.3 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  35.61 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  36.73 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  32.87 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  34.85 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  32.87 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  35.25 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0785  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  42.16 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  35.86 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  34.03 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  35.86 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  35.25 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  37.32 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  34.53 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  34.33 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  32.81 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  33.1 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  32.87 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  35 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  32.65 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  32.84 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  34.04 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  34.07 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  34.53 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  33.8 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  35.62 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  31.54 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  34.48 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  34.83 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  38.71 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  34.85 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  32.19 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 199 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  34.06 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  30.94 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  28.87 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  34.04 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  30.22 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  30.88 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  33.77 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  35.97 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  34.85 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>