270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2005 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 147 aa  299  7.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  49.66 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  48.3 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  50.38 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  48.18 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  43.06 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  45.07 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  43.45 
 
 		 150 aa  123  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  42.21 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  39.47 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  42.57 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  42.38 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  38 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  43.15 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  39.74 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  41.03 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  41.03 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  41.61 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  36.42 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  44.59 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  37.33 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  38.67 
 
 		 156 aa  106  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  38.41 
 
 		 154 aa  106  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  39.55 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  36.84 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  47.2 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  39.69 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  47.93 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  36.5 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  45.24 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  38.35 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  43.9 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  44.04 
 
 		 123 aa  95.1  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  43.09 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  45.87 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  33.76 
 
 		 163 aa  94.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  49.07 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  40.17 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  38.93 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  41.53 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  33.33 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  35.86 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  40.68 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  38.85 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  37.82 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  42.74 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  53.12 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  48.11 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  46.28 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  41.27 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  46.36 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  40.32 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  46.36 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  32.24 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 199 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2430  large conductance mechanosensitive channel protein  34.29 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.569149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  41.67 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  41.6 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  47.87 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  42.02 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  39.68 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  39.17 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  36.3 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  45.37 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  39.66 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  43.48 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  45.45 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  38.98 
 
 		 133 aa  85.9  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  40.32 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  44.64 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  41.18 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  39.84 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  40.62 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  43.97 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  46.67 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>