270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1671 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 150 aa  304  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  70.92 
 
 		 143 aa  214  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  65.31 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  64.08 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  63.95 
 
 		 152 aa  201  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  61.87 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  56.46 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  54.61 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  55.26 
 
 		 155 aa  171  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  55.94 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  55.56 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  59.03 
 
 		 145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  54.49 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  53.9 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  52.38 
 
 		 148 aa  160  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  61.15 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  54.36 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  52.7 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  48.98 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  48.7 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  48.68 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  57.39 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  58.04 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  46.45 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  45.14 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  56.78 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  52.71 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  53.24 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  52.71 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  51.49 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  52.38 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  55.75 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  55.93 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  58.56 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
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NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  53.12 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  51.56 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  51.13 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  51.13 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  51.13 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
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NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  51.49 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  57.6 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  51.97 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  57.6 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  57.6 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  57.6 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  55.08 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  54.95 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  43.15 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  47.9 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  43.45 
 
 		 147 aa  123  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  50.37 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  51.18 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  48.55 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  50.4 
 
 		 136 aa  121  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  53.51 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  54.96 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  54.2 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  52.21 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  52.8 
 
 		 136 aa  120  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  45 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  53.44 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  48.09 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  52 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  52.73 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
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NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  53.6 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  49.59 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  45.77 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  52.07 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  54.31 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  52.59 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  49.25 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
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NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  56.07 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  56.07 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.401904 
 
 
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NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  45.71 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  56.07 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  56.07 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  56.07 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.256612 
 
 
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NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  47.41 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
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