268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0387 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  93.06 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  55.24 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  53.9 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  49.33 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  51.7 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  47.68 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  47.59 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  48.73 
 
 		 157 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  46.48 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  49.03 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  45.27 
 
 		 156 aa  139  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  45.21 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  49.32 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  48.92 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  47.3 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  49.3 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  41.06 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  55.05 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  50.79 
 
 		 163 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  49.29 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  43.08 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  43.08 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  38.89 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  43.44 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  49.19 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  47.54 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  48.39 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  49.59 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  43.85 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  52.34 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  48.39 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  52.34 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  52.25 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  53.7 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  47.5 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  48.18 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  46.4 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  52.8 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  46.9 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  49.53 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  41.61 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  47.27 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  49.53 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  49.18 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  47.27 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  46.79 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  45.97 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  50.47 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  45.05 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  45.9 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  49.57 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  44.72 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  43.55 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  41.35 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  43.51 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  44.09 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  46.77 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  48.15 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  46.83 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  46.03 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  46.03 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  46.03 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  46.03 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  47.54 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  46.3 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  46.3 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  48.6 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  44.8 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  45.97 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  45.83 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>