268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0647 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 144 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  61.29 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  53.9 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  55.24 
 
 		 136 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  55.24 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  55.24 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  56.25 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  55.2 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  55.91 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  54.93 
 
 		 136 aa  156  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  55.17 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  62.9 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  62.41 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  52.74 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  55.17 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  55.17 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  51.06 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  55.17 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  55.24 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  55.48 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  59.65 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  53.52 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  54.48 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  56.06 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  54.17 
 
 		 133 aa  150  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  53.42 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  50.71 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  53.42 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  53.42 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  54.29 
 
 		 138 aa  147  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  52.82 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  52.82 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  54.17 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  50.71 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  50.7 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  50.72 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  52.78 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  48.63 
 
 		 131 aa  140  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  50.71 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  58.2 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  48.61 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  53.42 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  59.35 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1655  large conductance mechanosensitive channel protein  59.85 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  51.05 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  52.11 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  48.95 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  48.57 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  48.23 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  54.92 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  50.69 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  49.31 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  51.41 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  49.65 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  50.36 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  49.28 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  55.75 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  48.55 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  48.67 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  53.24 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  52.41 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  48.97 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  53.9 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  52.48 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  52.08 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  49.18 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  48.99 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  53.15 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  48.63 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  47.55 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>