268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2794 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 143 aa  287  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  76.22 
 
 		 145 aa  227  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  70.92 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  65.52 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  63.45 
 
 		 152 aa  194  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  58.04 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  55.24 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  64.14 
 
 		 145 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  63.57 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  54.25 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  59.31 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  60.56 
 
 		 147 aa  167  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  54.05 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  52.6 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  53.29 
 
 		 154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  53.15 
 
 		 156 aa  161  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  52.41 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  60 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  48.99 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  51.02 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  51.39 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  49.66 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  58.54 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  58.54 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  49.67 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  58.2 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  61.82 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  60.18 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  62.16 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  62.16 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  61.61 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  57.27 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 163 aa  130  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  56.78 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
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NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  58.47 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  52.67 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  53.78 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  58.47 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  54.78 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  54.17 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  58.88 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
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NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  59.48 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  49.59 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
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NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  49.59 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  58.62 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
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NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  58.4 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  60.36 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  59.48 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  56.25 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 136 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  52.46 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  55.65 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  50.7 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  57.76 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
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NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  43.97 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  53.79 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  58.12 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
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NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  60.36 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  56.45 
 
 		 199 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  54.46 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  57.66 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  47.55 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  54.95 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  53.17 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  53.91 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  43.45 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  55.65 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
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NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  53.45 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  56.88 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
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NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  55.65 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  47.24 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  52.76 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  55.65 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  43.84 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  52.27 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
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NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  54.03 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
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