270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3260 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  53.21 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  56.21 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  54.97 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  52.7 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  51.97 
 
 		 155 aa  157  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  49.66 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  51.01 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  53.29 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  44.74 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  47.26 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  49.01 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  49.01 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  46.58 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  52.03 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  52.03 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  52.03 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  54.46 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  46.48 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  45.7 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  51.35 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  60 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  38.06 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  49.57 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  51.26 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  40.41 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  41.03 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  43.15 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  43.15 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  49.09 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  47.32 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  46.67 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  35 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  48.62 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  47.75 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  50.45 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  50.45 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  41.22 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  40.98 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  46.36 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  49.09 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  40.98 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  45.13 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  47.75 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  42.52 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  50.88 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  41.55 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  49.55 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  43.86 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  45.6 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  39.42 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  44.2 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  38.78 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  47.75 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  41.09 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  44.2 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  41.91 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  41.91 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  43.48 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  46.9 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  41.6 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  41.91 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  47.37 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  41.91 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  37.04 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  42.03 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  46.02 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  45.95 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  44 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 199 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  43.31 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  42.28 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  43.65 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  43.31 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  43.31 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  42.73 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  43.31 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>