270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1319 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 126 aa  247  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  64.84 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  51.8 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  57.72 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  52.99 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  52.99 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  52.24 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  52.99 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  51.85 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  52.24 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  51.85 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  48.85 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  49.63 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  47.76 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  46.32 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  50.74 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.85 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  47.37 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  44.12 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  51.88 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  47.48 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  44.12 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  47.79 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  45.86 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  45.99 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  46.97 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  47.37 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  51.88 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  49.25 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  45.71 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  46.38 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  40.29 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  45.11 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  52.59 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  47.2 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  47.01 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  43.45 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  45.65 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02405  large conductance mechanosensitive channel protein  42.86 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.914683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  49.62 
 
 		 136 aa  105  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  47.76 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  45.65 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  43.75 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  45.14 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  51.52 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  48.57 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  43.66 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  42.55 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  44.06 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  44.06 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  41.3 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  43.66 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  44.12 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  48.2 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  51.97 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  44.76 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  42.25 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  49.24 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  50.43 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  44.72 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  43.2 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  50.75 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  41.55 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  44 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  42.4 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  47.62 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  45.45 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  41.43 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  42.66 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>