271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2603 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 143 aa  283  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  84.51 
 
 		 143 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  81.02 
 
 		 139 aa  230  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  80.71 
 
 		 138 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  75.18 
 
 		 159 aa  219  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  78.68 
 
 		 138 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  83.21 
 
 		 139 aa  215  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  68.31 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  63.7 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  67.65 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  64.49 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  64.71 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  64.71 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  63.12 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  60.71 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  61.76 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  56.46 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  57.45 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  57.82 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  55.56 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  56.43 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  62.96 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  58.09 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  51.41 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  54.29 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  49.63 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  53.73 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  50.7 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  57.35 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  57.04 
 
 		 146 aa  141  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  53.52 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  56.34 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  51.82 
 
 		 136 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  55.71 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  55.17 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 137 aa  137  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  50.71 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  53.28 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  51.05 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  48.25 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  55.71 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  54.41 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  47.55 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  49.29 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  52.55 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  54.35 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 		 142 aa  133  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  51.11 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  52.78 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  57.98 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  48.91 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  48.18 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 199 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  51.39 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  50.69 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  53.28 
 
 		 142 aa  130  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  53.28 
 
 		 142 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  55.71 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  52.74 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  53.9 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  52.52 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  55.15 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>