268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0386 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  55.48 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  54.79 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  54.79 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  54.79 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  54.79 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  54.79 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  54.42 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  51.05 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  58.04 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  53.42 
 
 		 199 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  53.47 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  49.65 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  53.47 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  51.05 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  52.14 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 146 aa  141  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  51.77 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  52.05 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  51.75 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  52.45 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  52.45 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  48.95 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  52.9 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  46.81 
 
 		 151 aa  137  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  48.25 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  54.11 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  51.45 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  47.55 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  50.68 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  56.85 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  59.35 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  54.79 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  53.19 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  48.23 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  46.43 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  50.35 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  55.83 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  51.05 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02405  large conductance mechanosensitive channel protein  51.75 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.914683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  47.92 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  47.89 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  46.04 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  49.32 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  49.65 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  49.3 
 
 		 142 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  50.34 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  55.07 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  52.86 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  52.52 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  51.77 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  49.3 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  47.55 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  43.36 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  48.95 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  45.83 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  48.95 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>