264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2430 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2430  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.569149  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  40.77 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  43.94 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  32.87 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  32 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  38.76 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  33.8 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  40.3 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  34.29 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  36.99 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  30.56 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  29.37 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  43.85 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  33.12 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  33.81 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  38.68 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  32.41 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  29.86 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  32.21 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  33.33 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  40.62 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  36.57 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  33.12 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  32.37 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  31.54 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  40.62 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 154 aa  84.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  42.71 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  32.43 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
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NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  46.51 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  41.49 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  38.39 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  40.57 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  38.54 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  38.54 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  38.54 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  38.54 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  32.87 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  35.86 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  38.54 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  35.04 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  31.47 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
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NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  31.47 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
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NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  39.18 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  48.15 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  35.83 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
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NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  40.7 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  38.3 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
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NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  33.91 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  40.37 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  43 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  38.3 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  38.3 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  31.33 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  31.33 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  43.96 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  36.79 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  29.85 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  34.82 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  36.84 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  36.79 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  36.79 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  36.79 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  36.97 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  39.62 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  36.07 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  39.62 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  31.94 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  39.45 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  28.37 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  37.84 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  35.2 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  36.29 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  36.44 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  41.88 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  36.07 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  36.07 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  39.64 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  33.6 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  35.2 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  40.95 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  39.06 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  39.62 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  35.87 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  35.09 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
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NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  36.79 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  38.68 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  29.69 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  38.32 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  39 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  38 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  34.78 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  37.84 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
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