272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0316 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 149 aa  297  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  67.13 
 
 		 132 aa  184  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  48.65 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  43.06 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  49.64 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  43.67 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  43.71 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  45.14 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  43.36 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  37.74 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  41.06 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  49.61 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  44.85 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  46.76 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  45.28 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  37.42 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  35 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  35 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  58.33 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  40.52 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  37.01 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  47.83 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  38.51 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  45.16 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  37.42 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  36.55 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  36.96 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  46.03 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  38.57 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  42.34 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  38.71 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  37.18 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  36.13 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  33.74 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  38.1 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  42.14 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  36.62 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  37.58 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  44.44 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  41.61 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  40.88 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  40.87 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  45.54 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  42.06 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  38.93 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  42.74 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  36.77 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  34.67 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  34.67 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  36.99 
 
 		 140 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  33.96 
 
 		 163 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  34.27 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  39.39 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  46.73 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  45.28 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  41.18 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  43.64 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  36.6 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  37.16 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  49.04 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  39.1 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  41.09 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  43.48 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 199 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  39.72 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  40.35 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  43.61 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  48.48 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  39.57 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  42.98 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  39.57 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  38.41 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  47.31 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  39.71 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  34.78 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  38.82 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  44.64 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>