271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2455 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 141 aa  270  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  65.49 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  63.12 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  63.38 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  68.57 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  64.08 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  61.7 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  67.61 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  61.7 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  67.61 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  67.86 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  65.49 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  69.23 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  58.57 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 199 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  57.64 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  57.64 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  57.64 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  56.94 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  63.57 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  56.94 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  56.94 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  58.87 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  65 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2428  large conductance mechanosensitive channel protein  63.57 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  57.55 
 
 		 140 aa  157  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3606  large conductance mechanosensitive channel protein  66.41 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  56.43 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  57.04 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  59.72 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0124  large conductance mechanosensitive channel protein  54.61 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.533935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  57.75 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  57.64 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  51.77 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  52.14 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  52.7 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  53.85 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  58.33 
 
 		 140 aa  141  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  52.11 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  52.7 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  56.55 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  57.34 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  51.02 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  57.24 
 
 		 143 aa  139  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  57.24 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  60 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  54.35 
 
 		 138 aa  137  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  56.2 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  53.62 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  55.86 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  52.17 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  55 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  54.29 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  56.64 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  51.09 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  53.28 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  53.68 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  53.62 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  48.59 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0622  large conductance mechanosensitive channel protein  53.85 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  52.55 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  45.45 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  52.52 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  51.43 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  53.62 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  48.92 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  48.25 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  51.82 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  51.82 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  50.35 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  48.18 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  51.45 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  48.78 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  48.61 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  46.67 
 
 		 138 aa  116  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  46.85 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  44.29 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  46.46 
 
 		 145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  47.89 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  46.9 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  46.58 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  50.46 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  45.38 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  46.58 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  52.42 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>