More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1775 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1775  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
403 aa  791    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000003497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4327  putative transcriptional regulator, GntR family  53.02 
 
 
411 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779983  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0424  putative transcriptional regulator, GntR family  43.91 
 
 
409 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.7 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02620  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  40.27 
 
 
382 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
393 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.89 
 
 
393 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.89 
 
 
393 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
393 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.61 
 
 
393 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
393 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
398 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  35.25 
 
 
393 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  35.83 
 
 
397 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 
398 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  34.14 
 
 
398 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  34.7 
 
 
393 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
414 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
395 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 
394 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
396 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 
400 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 
396 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 
396 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
398 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  33.7 
 
 
406 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 
395 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.73 
 
 
395 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 
396 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
398 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
397 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
383 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  33.06 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  30.15 
 
 
400 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  34.7 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  34.7 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  34.7 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  34.7 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  34.7 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  34.7 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
395 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
397 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
395 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
395 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  33.69 
 
 
417 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  34.81 
 
 
394 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 
400 aa  179  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
395 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
406 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0291  putative transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 
363 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
395 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  32.56 
 
 
406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 
367 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  30.27 
 
 
397 aa  173  5.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
406 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  33.51 
 
 
500 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  28.76 
 
 
405 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
396 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  28.61 
 
 
409 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 
396 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  33.24 
 
 
398 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0992  putative transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 
388 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 
394 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
450 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
399 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 
401 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 
425 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
407 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.43 
 
 
517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  31.81 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
383 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 
386 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
401 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
386 aa  164  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 
394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 
395 aa  163  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  28.61 
 
 
399 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  31.48 
 
 
400 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4999  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
364 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  28.42 
 
 
397 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
405 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 
416 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 
401 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  32.59 
 
 
554 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 
463 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
425 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 
402 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4485  aminotransferase, class I and II  29.78 
 
 
364 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0118141 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
400 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  29.74 
 
 
420 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
426 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>