More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0424 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0424  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 409 aa  791    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4327  putative transcriptional regulator, GntR family  48.07 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1775  putative transcriptional regulator, GntR family  43.62 
 
 		 403 aa  272  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000003497 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  32.16 
 
 		 390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02620  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.14 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.63 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0992  putative transcriptional regulator, GntR family  37.64 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321451  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  30.35 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 367 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 414 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  32.46 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  33.69 
 
 		 424 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  31.81 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1763  aminotransferase, class I and II  32.69 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59119  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  31.7 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  33.69 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4078  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  32.98 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  33.69 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  26.3 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  32.62 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4999  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  38.21 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4485  aminotransferase, class I and II  33.06 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0118141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  31.87 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  34.24 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  31.78 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  30.67 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 397 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1089  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 362 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0291  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  34.74 
 
 		 408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  34.74 
 
 		 408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  34.74 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  31.89 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1841  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358223  normal  0.366913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  31.76 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1987  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.675546  hitchhiker  0.00431824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  33.87 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2796  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  28.34 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  34.24 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  31.04 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  31.59 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  31.32 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  31.32 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>