More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4999 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4999  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 364 aa  730    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4485  aminotransferase, class I and II  93.68 
 
 		 364 aa  694    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0118141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0291  putative transcriptional regulator, GntR family  64.46 
 
 		 363 aa  478  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  60.91 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1089  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2796  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 398 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.06 
 
 		 393 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  36.83 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.06 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.06 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.46 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  36.9 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.61 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 425 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 414 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.34 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  33.24 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 388 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  33.81 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  36.9 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  36.9 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  36.9 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  36.9 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  36.9 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  36.9 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  31.68 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 395 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 340 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  33.52 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  36.12 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  35.31 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  36.07 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  37.4 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.41 
 
 		 436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  32.24 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  32.25 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.81 
 
 		 517 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 611 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 397 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  29.97 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  34.41 
 
 		 424 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  33.7 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  28.53 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  32.78 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 401 aa  183  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 405 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  31.04 
 
 		 432 aa  179  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  33.24 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  34.85 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  34.85 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  31.93 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  33.87 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>