More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0291 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0291  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 363 aa  734    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4485  aminotransferase, class I and II  64.74 
 
 		 364 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0118141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4999  GntR family transcriptional regulator  64.46 
 
 		 364 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  62.04 
 
 		 367 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1089  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2796  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.68 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.43 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 393 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.91 
 
 		 393 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.91 
 
 		 393 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 393 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.09 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  36.64 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 397 aa  203  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  35.46 
 
 		 393 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  34.14 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 393 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  32.57 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  35.46 
 
 		 393 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  35.46 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  35.46 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  35.46 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  35.46 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  35.46 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 397 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.24 
 
 		 517 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  33.71 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  33.7 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 438 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  31.32 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  32.57 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  29.2 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 394 aa  185  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 396 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.52 
 
 		 436 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  33.6 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  35.6 
 
 		 424 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1775  putative transcriptional regulator, GntR family  35.87 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000003497 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  35.42 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  34.53 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 611 aa  179  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 395 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 395 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  35.14 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  32.7 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  35.31 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  35.31 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 409 aa  172  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  34.32 
 
 		 397 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  34.88 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  35.31 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>