More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1744 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1744  integrase family protein  100 
 
 		 362 aa  692    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1780  integrase family protein  43.32 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  43.39 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4446  Site-specific recombinase XerD-like protein  39.52 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000279305  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  41.24 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19700  site-specific recombinase XerD  35.36 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0129569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  37.15 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  31.93 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  33.11 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 310 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  33.76 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.8 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.14 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.14 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.14 
 
 		 300 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  35.32 
 
 		 303 aa  99.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  32.27 
 
 		 310 aa  99.4  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.18 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  43.02 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.37 
 
 		 300 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.16 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  40.56 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  33.54 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  32.45 
 
 		 332 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.3 
 
 		 287 aa  95.9  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.54 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.52 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.06 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.48 
 
 		 309 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  34.62 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  40.57 
 
 		 302 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.7 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  35.79 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  33.19 
 
 		 277 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  29.7 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 305 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  30.97 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.32 
 
 		 307 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  25.24 
 
 		 307 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  37.65 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  39.45 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.36 
 
 		 302 aa  93.2  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 299 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.38 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.38 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.38 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.38 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.67 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.67 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.67 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  41.38 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  30.65 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  42.14 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.57 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  34.19 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.79 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  40.23 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.1 
 
 		 302 aa  91.3  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  40.49 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.83 
 
 		 290 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  41.82 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.38 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  30.64 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.34 
 
 		 330 aa  90.5  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  33.12 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  32.27 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.85 
 
 		 316 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.09 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  31.88 
 
 		 311 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.1 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  42.04 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 		 308 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 		 298 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.97 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  33.43 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  33.67 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  41.4 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  26.95 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  39.15 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  34.39 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.77 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.64 
 
 		 450 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.07 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  29.97 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.64 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>