60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4856 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4856  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274271  normal  0.0158859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  76.29 
 
 		 579 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  72.16 
 
 		 579 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  73.56 
 
 		 579 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  72.41 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  71.26 
 
 		 587 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  68.97 
 
 		 579 aa  124  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  70.11 
 
 		 579 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  70.11 
 
 		 579 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  68.97 
 
 		 579 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  67.82 
 
 		 625 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  67.82 
 
 		 579 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  68.97 
 
 		 584 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  66.29 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  67.06 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  67.82 
 
 		 579 aa  116  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  65.52 
 
 		 578 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  67.06 
 
 		 603 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  65.52 
 
 		 579 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  64.71 
 
 		 583 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  62.35 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  64.71 
 
 		 579 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  57.29 
 
 		 584 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  57.29 
 
 		 584 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  61.18 
 
 		 583 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0855  hypothetical protein  63.51 
 
 		 218 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.166171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  56.47 
 
 		 583 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  56.47 
 
 		 581 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  52.94 
 
 		 573 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  54.55 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  51.14 
 
 		 587 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  52.27 
 
 		 597 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  48.31 
 
 		 587 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  36.76 
 
 		 661 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  36.76 
 
 		 786 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  35.29 
 
 		 678 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  49.02 
 
 		 662 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  52 
 
 		 703 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  38.33 
 
 		 655 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  35.29 
 
 		 658 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  35.71 
 
 		 700 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  35.29 
 
 		 701 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  39.29 
 
 		 657 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  46.15 
 
 		 683 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  35.29 
 
 		 657 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  44.07 
 
 		 707 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  39.66 
 
 		 683 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  34.29 
 
 		 683 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  44 
 
 		 570 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  37.5 
 
 		 793 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  50 
 
 		 661 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  34.29 
 
 		 703 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  33.82 
 
 		 661 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  60 
 
 		 654 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  32.86 
 
 		 667 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  33.82 
 
 		 662 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  41.18 
 
 		 653 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  40.82 
 
 		 657 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  33.82 
 
 		 665 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  39.58 
 
 		 660 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>