216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4460 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  52.06 
 
 
265 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  51.31 
 
 
278 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  50.19 
 
 
278 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  48.68 
 
 
281 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  44.27 
 
 
280 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  46.21 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  45.83 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  46.59 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  47.55 
 
 
264 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  45.83 
 
 
262 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  45.45 
 
 
264 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  43.51 
 
 
268 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  47.62 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  43.13 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  44.32 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  46.21 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  45.06 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  42.64 
 
 
284 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  38.2 
 
 
266 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  43.89 
 
 
280 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  40.07 
 
 
272 aa  165  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  44.66 
 
 
280 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  43.13 
 
 
273 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  34.94 
 
 
262 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  36.12 
 
 
262 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  34.44 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.1 
 
 
242 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.46 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.02 
 
 
272 aa  92  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.33 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  28.62 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.14 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.7 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.94 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.31 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.31 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.1 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  35.8 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.21 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.3 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.41 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.29 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  33.52 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  31 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  35 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  22.99 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  40.43 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  33.6 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.37 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  27.87 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  32 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  36.97 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  33.72 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  26.92 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  41.67 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  30.73 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  38.39 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  31.2 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.35 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  38.39 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  29.39 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  36.42 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.43 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  32.76 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.63 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  32.04 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.73 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.39 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  35.91 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  31.62 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  27.03 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  33.02 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  29.72 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.04 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.04 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  30.04 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  27.05 
 
 
266 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  34.08 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  37.78 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  29.12 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.99 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  37.59 
 
 
253 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  29.86 
 
 
259 aa  62.4  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  27.83 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  32.38 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  29.09 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  29.66 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  26.58 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  34.45 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  34.78 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  28.3 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  31.31 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  25.37 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  28.86 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  28.86 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>