285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1004 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 511 aa  1035    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  55.71 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  54.11 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  56.55 
 
 		 532 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  51.38 
 
 		 517 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  56.55 
 
 		 532 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  53.03 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  56.7 
 
 		 540 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  56.7 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  56.95 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  54.22 
 
 		 520 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  52.81 
 
 		 519 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  54.53 
 
 		 521 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  54.51 
 
 		 521 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  53.59 
 
 		 531 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  54.53 
 
 		 521 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  55.63 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  49.9 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  54.3 
 
 		 521 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  53.72 
 
 		 531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  54 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  53.78 
 
 		 524 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  53.78 
 
 		 524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  55.56 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  53.78 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  52.55 
 
 		 520 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  53.2 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  51.18 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  53.56 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  53.55 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  46.56 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  45 
 
 		 715 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  35.61 
 
 		 516 aa  276  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  36.33 
 
 		 509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  36.11 
 
 		 511 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  34.44 
 
 		 511 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  35.61 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  35.61 
 
 		 519 aa  260  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  37.7 
 
 		 508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  35.85 
 
 		 518 aa  259  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  37.71 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  32.86 
 
 		 508 aa  257  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  38.06 
 
 		 535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  35.35 
 
 		 507 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  37.68 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  33.93 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  36.95 
 
 		 518 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 518 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  36.56 
 
 		 518 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  32.67 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  37.02 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  36.04 
 
 		 530 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  37.31 
 
 		 516 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  36.32 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  35.78 
 
 		 520 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  34.08 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  35.81 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  33.88 
 
 		 510 aa  246  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  34.99 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  33.88 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  34.61 
 
 		 510 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  36.15 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  36.68 
 
 		 507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  35.92 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  36.5 
 
 		 507 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 		 506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0796  histidine ammonia-lyase  39.91 
 
 		 506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  37.36 
 
 		 515 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  36.49 
 
 		 507 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  35.7 
 
 		 511 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  36.27 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  36.5 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  35.51 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 533 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  35.01 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  36.36 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  34.74 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  34.74 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  36.09 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  36.56 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  35.22 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  35.5 
 
 		 507 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1264  histidine ammonia-lyase  37.31 
 
 		 518 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  34.74 
 
 		 513 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  34.74 
 
 		 513 aa  240  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  34.74 
 
 		 513 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 567 aa  240  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  34.52 
 
 		 513 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 514 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1932  histidine ammonia-lyase  35.96 
 
 		 520 aa  239  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 510 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>