More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4798 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4798  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177253  normal  0.0723657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  36.84 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  34.55 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  34.31 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  34.82 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  31.44 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  31.44 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  35.12 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.7 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.08 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.13 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  33.78 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  35.66 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  39.22 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  33.45 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.64 
 
 		 327 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  30.13 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  31.51 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  36.9 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  31.68 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  34.57 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  33.21 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  31.99 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  33.92 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  34.44 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  35.44 
 
 		 329 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  35.09 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.1 
 
 		 335 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  33.09 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  33.46 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  33.22 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  33.22 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  34.05 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  29.57 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  31.97 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  34.51 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  32.55 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.07 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  31.35 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  29.07 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  31.35 
 
 		 345 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  32.28 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  32.5 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  34.02 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  31.12 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  36.25 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  33.22 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  31.95 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.6 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  30.92 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  30.94 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  32.96 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  32.54 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.82 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  30.51 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  36.13 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  33.8 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  34.98 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  36.67 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  35.4 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  33.58 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.41 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  31.63 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  33.6 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  32.14 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  35.83 
 
 		 329 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  32.28 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4218  hypothetical protein  31.21 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  32.41 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  31.23 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  32.76 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  32.47 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  34.25 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  32.41 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  32.13 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  29.51 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  32.64 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.22 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  29.51 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  33.91 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  32.86 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  32.38 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  32.09 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  31.25 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  32.41 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  33.07 
 
 		 349 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  34.44 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  33.46 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  33.45 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>