More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3545 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  55.97 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  53.58 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  49.83 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  49.83 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  49.83 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  51.4 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  48.65 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  47.33 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  44.27 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  36.64 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  34.13 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  35.81 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  36.12 
 
 		 330 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  30.6 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  36.15 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  34.36 
 
 		 336 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  33.78 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  34.9 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  35.71 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  32.43 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  34.86 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  33.78 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.99 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  35.09 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  32.89 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  35.16 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  35.88 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  33.23 
 
 		 335 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.94 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  31.33 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  32.66 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  35.07 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.13 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  32.86 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  34.34 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  32.11 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  31.76 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.1 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  31.76 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  34.75 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  32.35 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.79 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  30.98 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  32.1 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  33.64 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  33.01 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.4 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.36 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  33.75 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  31.94 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  33.13 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  32.67 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.62 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  35.06 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  32.82 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.23 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  32.57 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  32.92 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  35.16 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.2 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  30.23 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5507  hypothetical protein  34.52 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  32.22 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  31.48 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  33.44 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  38.91 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  33.11 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  34.22 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  32.69 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.25 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  33.67 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  34.21 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  30.34 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  34.98 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  31.88 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  31.31 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  37.08 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  32.72 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  33.95 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3320  hypothetical protein  35.29 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  33.66 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  29.91 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  31.68 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  35.77 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  31.65 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  31.38 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  32.99 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  31.02 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  31.44 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  33.13 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.42 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>