60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1748 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  63.17 
 
 		 918 aa  1199    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  56.51 
 
 		 929 aa  989    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  38.11 
 
 		 912 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1287  putative DNA methylase  74.51 
 
 		 932 aa  1404    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000167364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5334  type II restriction enzyme methylase subunit  68.44 
 
 		 926 aa  1320    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7690  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  58.08 
 
 		 622 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  60.5 
 
 		 909 aa  1115    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1748  putative DNA methylase  100 
 
 		 928 aa  1927    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.431397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  66.31 
 
 		 928 aa  1268    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  64.96 
 
 		 926 aa  1233    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4499  putative DNA methylase  60.45 
 
 		 921 aa  1133    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154819  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0028  hypothetical protein  38.91 
 
 		 916 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  38.34 
 
 		 914 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  40.13 
 
 		 871 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1309  methylase  33.6 
 
 		 933 aa  484  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00329115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1744  DNA methyltransferase  32.46 
 
 		 909 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000656447  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5634  methylase  33.72 
 
 		 937 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  32.25 
 
 		 908 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2607  methylase  31.81 
 
 		 928 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.483035  decreased coverage  0.00951903 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  33.71 
 
 		 919 aa  414  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2393  Type II restriction enzyme methylase subunits-like protein  30.72 
 
 		 934 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.233566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2250  hypothetical protein  31.86 
 
 		 929 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4502  hypothetical protein  32.53 
 
 		 955 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.264892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5513  hypothetical protein  30.86 
 
 		 934 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.032293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4906  hypothetical protein  30.11 
 
 		 941 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1173 aa  164  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  24.2 
 
 		 978 aa  151  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1151 aa  147  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  27.66 
 
 		 621 aa  130  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1184 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1018 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1154 aa  118  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1188 aa  111  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  24.37 
 
 		 973 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  23.31 
 
 		 925 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1170 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  25.47 
 
 		 918 aa  106  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0349  hypothetical protein  56.84 
 
 		 115 aa  98.6  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  22.06 
 
 		 1186 aa  92.8  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  22.47 
 
 		 869 aa  82.4  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1615  hypothetical protein  33.71 
 
 		 97 aa  66.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000631366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  24.54 
 
 		 536 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.48 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1347 aa  60.1  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1363 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.27 
 
 		 995 aa  52.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1298 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1409 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1339 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1353 aa  50.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  22.75 
 
 		 974 aa  50.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1366 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1282 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1459 aa  49.3  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1290 aa  48.9  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1373 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1342 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  27.81 
 
 		 1041 aa  45.8  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  25.93 
 
 		 504 aa  45.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.55 
 
 		 950 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>