160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3969 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
346 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  67.55 
 
 
351 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  60.95 
 
 
340 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
352 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  39.42 
 
 
344 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.98 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.63 
 
 
362 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  37.93 
 
 
341 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  36.11 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.67 
 
 
335 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  36.31 
 
 
339 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  32.81 
 
 
335 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  33.12 
 
 
335 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.68 
 
 
336 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.3 
 
 
353 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  30.6 
 
 
353 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  31.73 
 
 
337 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  30.57 
 
 
349 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.52 
 
 
351 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.21 
 
 
331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  26.27 
 
 
339 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.68 
 
 
336 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.58 
 
 
332 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.11 
 
 
338 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  28.52 
 
 
329 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.27 
 
 
336 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  24.23 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.87 
 
 
686 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
915 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  23.92 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.73 
 
 
593 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  26.62 
 
 
674 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  24.28 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  26.02 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  25.21 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.16 
 
 
1238 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.17 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.54 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  25.57 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.24 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  24.03 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.3 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.27 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.69 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.74 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.62 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.58 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  23.6 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.63 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.13 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.69 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.72 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  25.41 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.25 
 
 
1075 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.64 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.38 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  27.97 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.81 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.19 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  23.56 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.6 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.83 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  27.24 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.33 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.24 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  25.57 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.35 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  24.71 
 
 
327 aa  59.7  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  23.85 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25.12 
 
 
778 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.11 
 
 
322 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  24.33 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.22 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  21.88 
 
 
1065 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  22.82 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  25.63 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.98 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.96 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  25.11 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  22.94 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  27.19 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  19.83 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  21.83 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.72 
 
 
342 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.5 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.93 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  24.66 
 
 
775 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  24.83 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  26.28 
 
 
317 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  25.28 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  24.18 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  23.77 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  24.91 
 
 
336 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  24.07 
 
 
348 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  24.54 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  25.52 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  22.47 
 
 
856 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>