More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3602 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  80.27 
 
 		 447 aa  723    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  83.48 
 
 		 447 aa  749    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  74.32 
 
 		 446 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  76.16 
 
 		 446 aa  668    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  894    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  66.89 
 
 		 447 aa  607  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  64.99 
 
 		 440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  64.71 
 
 		 444 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  67.58 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  64.3 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  64.5 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  63.76 
 
 		 442 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  63.22 
 
 		 442 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  63.62 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  63.62 
 
 		 444 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  63.76 
 
 		 448 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  63.62 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  63.53 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  63.39 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  64.63 
 
 		 451 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  63.16 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  65.06 
 
 		 450 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  65.06 
 
 		 451 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  63.3 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  63.3 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  63.3 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  63.3 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  63.3 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  64.61 
 
 		 441 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  63.3 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  63.3 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  62.41 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  64.04 
 
 		 441 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  64.52 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  64.06 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  61.98 
 
 		 444 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  62.9 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  59.27 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  55.48 
 
 		 443 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  59.04 
 
 		 444 aa  501  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  50.34 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  48.41 
 
 		 448 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  47.81 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  44.47 
 
 		 442 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  41.53 
 
 		 451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  40.55 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  40.41 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  40.24 
 
 		 470 aa  302  7.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  37.97 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  35.95 
 
 		 459 aa  292  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  35.18 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  43.58 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  38.15 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.11 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  38.04 
 
 		 461 aa  272  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.21 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  37.39 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  37.84 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  37.84 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  38.41 
 
 		 449 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.3 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  39.3 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.07 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  36.95 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  38.11 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  37.95 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  37.95 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  37.95 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  37.95 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  37.95 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.53 
 
 		 449 aa  265  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  37.41 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.08 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  32.74 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  37.73 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38.08 
 
 		 446 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.08 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.08 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  38.02 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.08 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  38.06 
 
 		 478 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  38.13 
 
 		 466 aa  262  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.97 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  38.23 
 
 		 464 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  37.5 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  36.97 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.49 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  37.2 
 
 		 462 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  37.5 
 
 		 446 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  36.94 
 
 		 448 aa  259  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  39.91 
 
 		 444 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  36.03 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  37.97 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  37.16 
 
 		 468 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  33.65 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  37.19 
 
 		 438 aa  257  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.3 
 
 		 460 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  37.23 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0493  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.02 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.45552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  35.24 
 
 		 459 aa  256  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>